第１７２回遺伝子技術講習会

「トミーデジタルバイオロジーがご提案する次世代シークエンサー（NGS）関連商品のご紹介」

　弊社トミーデジタルバイオロジーではお客様のニーズに合わせて次世代シーケンサーから、ソフトウェア、試薬まで様々なNGS関連商品を取り揃えております。本セミナーでは各製品に関しての特徴やアプリケーションに関してご紹介いたします

日　時： ２０１７年１０月１９日（木）

　　　　第１部　１４:００～１５:３０（Q&A含む）
　　　　第２部　１７:００〜１８:３０（Q&A含む）　＊内容は同一です。

場　所： 熊本大学　生命資源研究・支援センター　遺伝子実験施設　6階　講義室【602】　　　　
講　師：トミーデジタルバイオロジー（株）　岡留氏、橋本氏
要　旨：

　PacificBiosciences社製Sequelシークエンサーは、現在ではN50は20kb、最長60kb以上の圧倒的なロングリードでシークエンスを行い、1 SMRT cell当たり5–8 Gbを出力することが可能です。例えば1回のシークエンスでバクテリアゲノムを99.999%の精度でコンプリートすることができ、最近では植物や動物、更にはヒトゲノムのデノボアセンブリや構造変異解析にも使⽤されるようになりました。本セミナーでは⼤きく進歩した最先端PacBioシークエンサーの最新情報と、アプリケーションについてをお話しします。

　Swift Biosciences社はIllumina® シークエンサーあるいはIon Torrent™ シークエンサー向けの、ユニークなライブラリ調製用キットを提供しています。「Accel-NGS」シリーズは次世代シークエンサーのためのライブラリ調製を迅速に行い、有益なデータを得ることができるようにデザインされています。少ないインプットから複雑性の高いライブラリを調製することができ、幅広いインプット量で優れたカバレッジを実現します。

　Strand NGSは、次世代シーケンスデータの解析、マネジメント、図示化ができる統合的なツールです。RNA-Seq, DNA-Seq, ChIP-Seq, Methyl-Seq, small RNA-Seq, MeDIP-Seqに対応しています。スタンダードな生物種のシーケンスアノテーションを簡単にダウンロードでき、その他の生物種についてもアノテーションを作成することが可能です。使い易いインターフェースと操作性により、煩雑なNGS解析をスムースに行うことができ、GeneOntology、GSEA、Pathway解析などで生物学的解釈をることも可能です。

　Geneiousは様々なバイオインフォマティクスツールを一つにまとめた多彩なソフトウェアです。NGSデータの解析、クローニングのシミュレーション、マイクロサテライト解析、16S rRNAを使用した生物多様性解析などが行えます。2005年にリリースされてから、世界のTop20大学(Times Higher Education, 2012) や、大規模な製薬企業、世界中の有名な研究所でも広く使用されています。